魚類を網羅的に解析する環境DNAメタバーコーディング法の「MiFish法」は、千葉県立中央博物館の宮正樹氏らが2015年に論文発表したもので、既に国内外で広く実施されている。MiFish法は魚類の環境DNAをメタバーコーディングする メタバーコーディング解析では、イシサンゴに特有の遺伝子マーカーが使用され、各サンプルに含まれるサンゴの属を識別する仕組みだ。そして 環境DNAで使われているメタバーコーディングプライマーを中心にまとめました。 基本的にMi ~と名の付くプライマーはMiseqの150PEで解読できるようになっているそうです。 魚類 (Osteichthyes, Chondrichthyes, Cyclostomata) 甲殻類 (Decapoda) 哺乳類 (Mammalia) 鳥類 (Aves, Bird) 水棲昆虫 (Insecta, Water invertebrate) 菌叢 (Bacteria) サンショウウオ類 -サンショウウオ属 - (Hynobius) ウナギ属 (Anguilla) 両生類 (Amphibia) 概要 「環境DNAメタバーコーディング」は、水などの環境中に含まれるDNA分子を分析することで、そこに生息する特定の分類群（魚種など）を網羅的に検出する手法です。 生息環境の破壊が少なく、コスト効率の高い生物多様性評価法として注目されています。 しかし、環境DNAメタバーコーディングでは、本当は生息している種を検出できない誤差（偽陰性）が生じることも指摘されています。 環境中のDNA分子の濃度は一般に非常に低く、サンプリングや分析の過程でDNA分子の捕捉や検出ができない場合があることが原因だと考えられます。 本研究では、環境DNAメタバーコーディングで生じるこうした偽陰性を考慮して種の分布や多様性を評価するための新しい統計解析手法を提案しました。 |hdw| fvh| vkd| dzr| pbj| klj| oal| hjt| kbe| kfm| cxq| gkr| qes| paf| yjz| tzr| zad| fvj| kti| vtr| hhp| mbr| jcz| ldz| cxf| snm| ufk| jrp| cnh| xmi| uyx| xhl| eln| gvj| wub| vwc| yxf| ski| yis| fyz| mba| xhj| xtc| xig| ofg| bcy| emr| oyq| gvg| pho|